Список публикаций

(с 2006 по н.в.)

 

  1. Bespyatykh J., Shitikov E., Butenko I., Altukhov I., Alexeev D., Mokrousov I., Dogonadze M., Zhuravlev V., Yablonsky P., Ilina E., Govorun V. Proteome analysis of the Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148 cluster. Scientific Report. 2016. 6, 28985; doi: 10.1038/srep28985. (http://www.nature.com/articles/srep28985)
  2. Kornienko М., Ilina E., Lubasovskaya L., Priputnevich T., Falova O., Sukchikch G., Govorun V. Analysis of nosocomial Staphylococcus haemolyticus by MLST and MALDI-TOF Mass Spectrometry. Infection, Genetics and Evolution, (2016), pp. 99-105.
  3. Корниенко М.А., Копыльцов В.Н., Шевлягина Н.В., Диденко Л.В., Любасовская Л.А., Припутневич Т.В., Ильина Е.Н. Способность стафилококков различных видов к образованию биопленок и их воздействие на клетки человека. Молекулярная генетика микробиология и вирусология, № 1 2016. 
  4. Sotnikova EA, Shitikov EA, Malakhova MV, Kostryukova ES, Ilina EN, Atrasheuskaya AV, Ignatyev GM, Vinokurova NV, Gorbachyov VY. Complete Genome Sequence of Mycobacterium bovis Strain BCG-1 (Russia) Genome Announc. 2016 Mar 31;4(2). pii: e00182-16. doi: 10.1128/genomeA.00182-16 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4816620/)
  5. Бодоев И.Н., Ильина Е.Н. МОЛЕКУЛЯРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ ФОРМИРОВАНИЯ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ NEISSERIA GONORRHOEAE: ИСТОРИЯ И ВЗГЛЯД В БУДУЩЕЕ Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2015. Т. 33. № 3. С. 22-27.
  6. Чаплин А.В., Бржозовский А.Г., Парфёнова Т.В., Кафарская Л.И., Володин Н.Н., Шкопоров А.Н., Ильина Е.Н., Ефимов Б.А. ИЗУЧЕНИЕ ВИДОВОГО РАЗНООБРАЗИЯ БАКТЕРИЙ РОДА BIFIDOBACTERIUM КИШЕЧНОЙ МИКРОФЛОРЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДА MALDI-TOF МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ Вестник Российской академии медицинских наук. 2015. № 4 (70). С. 435-440.
  7. Ikryannikova L.N., Ischenko D.S., Kanygina A.V., Karpova I.Y., Kostryukova E.S., Ilina E.N., Govorun V.M., Lominadze G.G., Mayansky N.A., Skvortsov V.S. THE MYSTERY OF THE FOURTH CLONE: COMPARATIVE GENOMIC ANALYSIS OF FOUR NON-TYPEABLE STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE STRAINS WITH DIFFERENT SUSCEPTIBILITIES TO OPTOCHIN European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 2015.
  8. Chernyaeva E.N., Rotkevich M.S., Dobrynin P.V., Simonov S.A., Lapidus A.L., O'Brien S.J., Shulgina M.V., Zhuravlev V.Y., Manicheva O.A., Yablonsky P.K., Shitikov E.A., Ischenko D.S., Karpova I.Y., Kostryukova E.S., Ilina E.N., Govorun V.M., Isaeva Y.D., Nosova E.Y., Mokrousov I.V., Vyazovaya A.A. et al. GENOME-WIDE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS VARIATION (GMTV) DATABASE: A NEW TOOL FOR INTEGRATING SEQUENCE VARIATIONS AND EPIDEMIOLOGY BMC Genomics. 2014. Т. 15. № 1. С. 308 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4234438/)
  9. Bespyatykh J. A., Shitikov E. A., Ilina E. N., Govorun V. M., Zimenkov D. V., Kulagina E. V., Lapa S. A., Gryadunov D. A. Spoligotyping of Mycobacterium tuberculosis complex isolates using hydrogel oligonucleotide microarrays. Infection, Genetics and Evolution. 2014. Т. 26. С. 41-46 ()
  10. Shitikov E. A., Bespyatykh J. A., Ischenko D. S., Alexeev D. G., Karpova I. Y., Kostryukova E. S., Isaeva Y. D., Nosova E. Y., Mokrousov I. V., Vyazovaya A. A., Narvskaya O. V., Vishnevsky B. I., Otten T. F., Zhuravlev V. Y.,Yablonsky P. K., Govorun V. M Unusual Large-Scale Chromosomal Rearrangements in Mycobacterium tuberculosis Beijing B0/W148 Cluster Isolates. PLOS ONE, 2014, 9 (1), e84971 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3885621/ )
  11. Зименков Д. В., Кулагина Е. В., Антонова О. В., Суржиков С. А., Беспятых Ю. А., Шитиков Е. А., Ильина Е. Н., Михайлович В. М., Заседателев А. С., Грядунов Д. А. Анализ генетических детерминант множественной и широкой лекарственной устойчивости возбудителя туберкулеза с использованием олигонуклеотидного микрочипа // Молекулярная биология. 2014. Т. 48. № 2. С. 251-264 (http://naukarus.com/analiz-geneticheskih-determinant-mnozhestvennoy-i-shirokoy-lekarstvennoy-ustoychivosti-vozbuditelya-tuberkuleza-s-ispolzo)
  12. Беспятых Ю. А., Шитиков Е. А., Зименков Д. В., Кулагина Е. В., Грядунов Д. А., Носова Е. Ю., Букатина А. А., Шульгина М. В., Журавлев В. Ю., Ильина Е. Н. Определение лекарственной устойчивости и генотипирование клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis экспериментальным набором «ТБ-ТЕСТ» Пульмонология, 2013.-N 4.-С.77-81 (http://www.fesmu.ru/elib/Article.aspx?id=287903)
  13. Агеевец В.А., Партина И.В., Лисицына Е.С., Батыршин И.М., Попенко Л.Н., Шляпников С.А., Ильина Е.Н., Сидоренко С.В. Чувствительность грамотрицательных бактерий, продуцентов карбапенемаз, к антибиотикам различных групп. Антибиотики и химиотерапия, 2013.-N 3.-С.10-13.  (http://www.fesmu.ru/elib/Article.aspx?id=281435)
  14. Ilina EN, Malakhova MV, Bodoev IN, Oparina NY, Filimonova AV, Govorun VM. Mutation in ribosomal protein S5 leads to spectinomycin resistance in Neisseria gonorrhoeae. Frontiers in microbiology. 01/2013; 4:186. doi: 10.3389/fmicb.2013.00186.
  15. Любасовская Л.А., Корниенко М.А., Припутневич Т.В., Ильина Е.Н., Щеголев А.И. Микробиологическая и молекулярно-генетическая характеристика коагулазонегативных стафилококков, выделенных у новорожденных отделения реанимации и интенсивной терапии. «Антибиотики и химиотерапия», 2013, 58; 3-4, 26 – 33
  16. Ilina EN, Shitikov EA, Ikryannikova LN, Alekseev DG, Kamashev DE, Malakhova MV, Parfenova TV, Afanas'ev MV, Ischenko DS, Bazaleev NA, Smirnova TG, Larionova EE, Chernousova LN, Beletsky AV, Mardanov AV, Ravin NV, Skryabin KG, Govorun VM. Comparative Genomic Analysis of Mycobacterium tuberculosis Drug Resistant Strains from Russia. PLoS ONE, 2013, 8(2): e56577. doi:10.1371/journal.pone.0056577
  17. Ikryannikova LN, Filimonova AV, Malakhova MV, Savinova T, Filimonova O, Ilina EN, Dubovickaya VA, Sidorenko SV, Govorun VM. Discrimination between S. pneumoniae and S. mitis based on sorting of their MALDI mass spectra. Clin Microbiol Infect. 2013 Nov; 19(11):1066-71. doi: 10.1111/1469-0691
  18. Kushnir AV, Ilina EN, Malakhova MV, Priputnevich TV, Filipenko ML. Multiple-locus variable number tandem repeat analysis of Neisseria gonorrhoeae isolates in Russia. Infect Genet Evol. 2012 Dec 19; 14C:8. doi: Infect Genet Evol. 2013 Mar; 14:8-14. doi: 10.1016/j.meegid.2012.11.020
  19. Корниенко М.А., Ильина Е.Н., Боровская А.Д., Эдельштейн M.В., Сухорукова M.В., Кострцева М., Говорун В.М. Прямое бактериальное профилирование посредством MALDI масс-спектрометрии как метод быстрой классификации штаммов Staphylococcus aureus. Биомедицинская химия, 2012. Т. 58 N 5.-С.501-513.
  20. Shitikov E1, Ilina E, Chernousova L, Borovskaya A, Rukin I, Afanas'ev M, Smirnova T, Vorobyeva A, Larionova E, Andreevskaya S, Kostrzewa M, Govorun V. Mass spectrometry based methods for the discrimination and typing of mycobacteria. Infect Genet Evol. 2012 Jun; 12(4):838-45. doi: 10.1016/j.meegid.2011.12.013.
  21. Shevchenko OV, Mudrak DY, Skleenova EY, Kozyreva VK, Ilina EN, Ikryannikova LN, Alexandrova IA, Sidorenko SV, Edelstein MV. First detection of VIM-4 metallo-β-lactamase-producing Escherichia coli in Russia. Clin Microbiol Infect. 2012 Jul; 18(7):E214-7. doi: 10.1111/j.1469-0691.2012.03827.x. Epub 2012 Apr 4.
  22. Zubritskiĭ AV, Il’ina EN, Strel’chenko SA, Malakhova MV, Lenev SV, Skliarov OD, Panin AN, Govorun VM. Investigation of molecular mechanisms of aminoglycoside resistance in Salmonella. Antibiot Khimioter. 2011; 56(9-10):7-12. (In Russian).
  23. Ikryannikova LN, Lapin KN, Malakhova MV, Filimonova AV, Ilina EN, Dubovickaya VA, Sidorenko SV, Govorun VM. Misidentification of alpha-hemolytic streptococci by routine tests in clinical practice. Infect Genet Evol. 2011 Oct; 11(7):1709-15.
  24. Afanas’ev MV., Ikryannikova LN., Il’ina EN., Kuz’min AV., Larionova EE., Smirnova TG., Chernousova LN. and Govorun VM. Molecular typing of Mycobacterium tuberculosis circulated in Moscow, Russian Federation. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2011 Feb; 30(2):181-91. doi: 10.1007/s10096-010-1067-z.
  25. Боровская А. Д., Ильина Е. Н., Савинова Т. А., Сидоренко С. В., Грудинина С. А., Говорун В. М. Дифференцировка α-гемолитических стрептококков прямым масс-спектрометрическим профилированием. Биоорганическая химия, 2011, том 37, № 1, с. 61–69
  26. Ilina EN1, Borovskaya AD, Serebryakova MV, Chelysheva VV, Momynaliev KT, Maier T, Kostrzewa M, Govorun VM. Application of matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry for the study of Helicobacter pylori. Rapid Commun Mass Spectrom. 2010 Feb; 24(3):328-34. doi: 10.1002/rcm.4394.
  27. Афанасьев М.В., Каракашев С.В., Ильина Е.Н., Салем А.-С.-А.-М. , Сидоренко С.В. и Говорун В.М. Молекулярно-генетическая характеристика метициллин-устойчивых штаммов Staphylococcusaureus, выделенных в стационарах г. Москвы. Журнал «Молекулярная генетика, микробиология и вирусология» 2010, № 2, стр.20-24
  28. Ikryannikova LN., Shkarupeta MM., Shitikov EA., Il’ina EN., Govorun VM. Comparative evaluation of new typing schemes for urogenital Chlamydia trachomatis isolates. FEMS Immunol Med Microbiol. 2010, Jul 1; 59(2):188-96. doi: 10.1111/j.1574-695X.2010.00678.x
  29. Савинова Т.А., Ильина Е.Н., Сидоренко С.В. Масс-спектрометрический анализ генетических маркеров резистентности S. pneumoniae к бета-лактамным антибиотикам. Журнал «Молекулярная генетика, микробиология и вирусология» 2010, № 3
  30. Ilina EN, Oparina NY, Shitikov EA, Borovskaya AD, Govorun VM. Molecular surveillance of clinical Neisseria gonorrhoeae isolates in Russia. J of Clinical Microbiology, 2010 Oct; 48(10):3681-9
  31. Афанасьев М.В., Боровская А.Д., Ильина Е.Н., Смирнова Т.Г., Ларионова Е.Е., Кузьмин А.В., Андреевская С.Н., Черноусова Л.Н., Говорун В.М. Выявление мутаций в 306 кодоне embB гена для молекулярно-генетической характеристики клинических штаммов Mycobacterium tuberculosis. Пробл. тубер. болезн. легких. — 2009. — № 5. — C. 48 — 53.
  32. Малахова М.В., Ильина Е.Н., Говорун В.М., Шутько С.А., Дудина К.Р., Знойко О.О., Климова Е.А., Ющук Н.Д. Масс-спектрометрическое генотипирование вируса гепатита В. Бюлл. экспер. биол. мед. – 2009. – Т. 147. – № 2. – С. 181 — 187.
  33. Ильина Е.Н., Говорун В.М. Масс-спектрометрия нуклеиновых кислот в молекулярной медицине. Биоорганическая химия. – 2009. – Т. 35. – №. 2. – C. 149 — 164.
  34. Владимиров Г.Н., Кононихин А.С., Ильина Е.Н., Говорун В.М., Николаев Е.Н. Точное измерение масс продуктов полимеразно-цепной реакции как метод генотипирования. Труды МФТИ. – 2009. – Т. 1. — № 1. – C. 36 – 40.
  35. Ilina EN, Borovskaya AD, Malakhova MM, Vereshchagin VA, Kubanova AA, Kruglov AN, Svistunova TS, Gazarian AO, Maier T, Kostrzewa M, Govorun VM. Direct bacterial profiling by matrix-assisted laser desorption-ionization time-of-flight mass spectrometry for identification of pathogenic Neisseria. J Mol Diagn. 2009 11(1):75-86. doi: 10.2353/jmoldx.
  36. Атрошкина М.Е., Ильина Е.Н., Плахова К.И., Гомберг М.А., Кубанова А.А., Говорун В.М. Разработка ДНК- биочипа для исследования микробных сообществ. Молекулярная медицина. — 2009.- 3. — С.23 -31.
  37. Mellmann A, Bimet F, Bizet C, Borovskaya AD, Drake RR, Eigner U, Fahr AM, He Y, Ilina EN, Kostrzewa M, Maier T, Mancinelli L, Moussaoui W, Prévost G, Putignani L, Seachord CL, Tang YW, Harmsen D. High interlaboratory reproducibility of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry-based species identification of nonfermenting bacteria. J Clin Microbiol. 2009 Nov; V. 47, N. 11, P. 3732-3734. doi: 10.1128/JCM.00921-09
  38. Ilina EN1, Vereshchagin VA, Borovskaya AD, Malakhova MV, Sidorenko SV, Al-Khafaji NC, Kubanova AA, Govorun VM. Relation between genetic markers of drug resistance and susceptibility profile of clinical Neisseria gonorrhoeae strains. Antimicrobial Agents And Chemotherapy, 2008 Jun; 52(6):2175-82. doi: 10.1128/AAC.01420-07
  39. Ikryannikova LN, Shitikov EA, Zhivankova DG, Il’ina EN, Edelstein MV, Govorun VM. A MALDI TOF MS-based minisequencing method for rapid detection of TEM-type extended-spectrum beta-lactamases in clinical strains of Enterobacteriaceae. J Microbiol Methods. 2008 Dec; 75(3):385-91. doi: 10.1016/j.mimet.2008.07.005.
  40. Reinert RR, Filimonova OY, Al-Lahham A, Grudinina SA, Ilina EN, Weigel LM, Sidorenko SV. Mechanisms of macrolide resistance among Streptococcus pneumoniae isolates from Russia. Antimicrob Agents Chemother. 2008 Jun; 52(6):2260-2. doi: 10.1128/AAC.01270-07.
  41. Ющук Н.Д., Знойко О.О., Климова Е.А., Дудина К.Р., Кареткина Г.Н., Ильина Е.Н., Максимова С.Л. Генетическая изменчивость вирусов гепатита человека и ее клиническое значение. Москва, 2007 год.
  42. Боровская А.Д., Малахова М.В., Верещагин В.А., Ильина Е.Н., Говорун В.М., Припутневич Т.В., Аль-Хафаджи Н., Кубанова А.А. Анализ вклада молекулярных механизмов в формирование устойчивости гонококка к тетрациклину. Журнал «Бюллетень экспериментальной биологии и медицины», 2007, приложение 2, стр. 61 — 66.
  43. Afanas’ev MV, Ikryannikova LN, Il’ina EN, Sidorenko SV, Kuz’min AV, Larionova EE, Smirnova TG, Chernousova LN, Kamaev EY, Skorniakov SN, Kinsht VN, Cherednichenko AG, Govorun VM. Molecular characteristics of rifampicin and isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from the Russian Federation. J Antimicrob Chemother. 2007; 59(6):1057-64.
  44. Малахова М.В., Верещагин В.А., Ильина Е.Н., Говорун В.М., Филимонова О.Ю., Грудинина С.А., Сидоренко С.В. Применение метода MALDI-TоF масс-спектрометрии для анализа генетически детерминированной устойчивости S.pneumoniae к фторхинолонам. Антибиот. Химиотер. – 2007.- Т. 52. – № 1 — 2. – С. 10 – 17.
  45. Мудрак Д.Е., Икрянникова Л.Н., Сидоренко С.В., Ильина Е.Н. Изучение распространенности и молекулярных механизмов антибактериальной резистентности у грамотрицательных возбудителей нозокомиальных инфекций в стационарах Москвы и Перми. // Антибиот. химиотер. — 2007.- Т. 52. – № 7 — 8. – С. 10-16.
  46. Ильина Е.Н., Малахова М.В., Верещагин В.А., Говорун В.М., Припутневич Т.В., Кубанова А.А. Прямая оценка параметров лекарственной устойчивости гонококка/ Журнал «Бюллетень экспериментальной биологии и медицины», 2007 г., Том 144, № 8, 194-197.
  47. Ikryannikova LN, Afanas’ev MV, Akopian TA, Il’ina EN, Kuz’min AV, Larionova EE, Smirnova TG, Chernousova LN, Govorun VM. Mass-spectrometry based minisequencing method for the rapid detection of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis. J Microbiol Methods. 2007, 70(3):395-405.
  48. Афанасьев М.В., Икрянникова Л.Н., Ильина Е.Н., Смирнова Т.Г., Ларионова Е.Е., Кузьмин А.В., Черноусова Л.Н., Камаев Е.Ю., Скорняков С.Н., Киншт В.Н., Чередниченко А.Г., Говорун В.М. Применение минисеквенирования с последующей MALDI-TOF масс-спектрометрией для анализа развития устойчивости к рифампицину и изониазиду штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих в Российской Федерации. Журнал «Проблемы туберкулеза и болезней легких». 2007; № 7, стр. 37-42.
  49. Плахова К.И., Гомберг М.А., Атрошкина M.E., Ильина Е.Н., Говорун В.М. Идентификация микробного состава выделений из влагалища методами генодиагностики. Вест. дермат. венерол. – 2007. – № 6. – C. 9 — 13.
  50. Плахова К.И., Гомберг М.А., Атрошкина М.Е., Ильина Е.Н., Говорун В.М. Роль Atopobium vaginae при рецидивировании бактериального вагиноза// Вест. дермат. венерол. — 2007. – № 5. – C. 10 — 13.
  51. Малахова М.В., Верещагин В.А., Ильина Е.Н., Говорун В.М., Зубков М.М., Припутневич Т.В., Кисина В.И., Кубанова А.А. Анализ генетических маркеров резистентности N. gonorrhoeae к лактамным антибиотикам. // Бюлл. экспер. биол. мед. – 2006. – Т. 141. – № 5. – С. 549 — 554.
  52. Кубанова А.А., Говорун В.М., Ильина Е.Н., Верещагин В.А., Фриго Н.В., Припутневич Т.А. Первый опыт применения метода прямого белкового профилирования для идентификации и типирования N. gonorrhoeae. // Вест. дермат. венерол. – 2006. – № 5. – C. 25 — 29.