1. Explanation of Helicobacter Pylori Virulence and Adaptation Based on Proteogenomic Analysis. Dmitry Alexeev, Russian Institute Of Physico-Chemical Medicine, Moscow, RU. ISCB Symposium 2011.
2. Core proteome of Helicobacter pylori strains deduced from proteogenomic comparsion between laboratory strains and clinical isolate sheds light on possible evolution and adaptation of virulence mechanisms. Dmitry Alexeev. HUPO 2011 World Congress.
3. Web-application for comparative structural and functional analysis of prokaryotic genomes sequencing data. Ilya Altukhov. MCCMB'11.
4. Temporal evolution of gut microbiota during chemotherapy in acute leukemia pediatric patients. Tyakht A.V., Popenko A.S., Zelenin A.S., Kovarsky B.A., Alexeev D.G., Karpova I.Y., Larin A.K., Solopova G.G., Dzhandarova D.T., Roumiantsev S.A., Kostryukova E.S., International Human Microbiome Congress (IHMC), Hangzhou, 2013.
5. Peskov, K., Kosinsky, Y., Popenko, A., Tyakht, A., & Alexeev, D. (2012, September). Mechanistic modeling approach relating human gut microbial community to physiologically-relevant biomarkers. In SYSPATHO WORKSHOP SYSTEMS BIOLOGY AND MEDICINE (p. 53).
6. Метагеномный анализ микробиоты населения РФ. Тяхт А.В., Попенко А.С., Беленикин М.С., Павленко А.В., Алексеев Д.Г. III международная научно-практическая конференция "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине", Казань, 2012.
7. И.А. Алтухов «Количественная безметочная протеомика и системный анализ штаммов Helicobacter pylori», Конференция молодых ученых НИИ ФХМ, Москва, 2013
8. Д.С. Ищенко "Разработка программного комплекса для анализа бактериальных данных", Конференция молодых ученых НИИ ФХМ, Москва, 2013
9. И.А. Алтухов, Д.С. Ищенко, Ковальчук С.И. и Д.Г. Алексеев, «Количественная безметочная протеомика и системны анализ штаммов Helicobacter pylori», Международная научная школа для молодёжи и преподавателей «Прикладные математика и физика: от фундаментальных исследований к инновациям»", Москва, 2013
10. И.А. Алтухов «Сравнительный геномный анализ штаммов Helicobacter pylori и Neisseria gonorrhoeae». Международная конференция "Высокопроизводительное секвенирование в геномике", Новосибирск, 2013
11. Д.С. Ищенко «Толерантность протеомных данных». Х студенческая конференция факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ, Москва, 2013
12. А.С. Зеленин "Структура бактериального сообщества пищеварительного тракта криптобиотической хирономиды Polypedilum vanderplanki с позиции метагеномного анализа". Международная конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике», Новосибирск, 2013
13. Б.А. Коварский, Д.Г. Алексеев, Анализ генетического разнообразия в метагеноме кишечника человека. Конференция молодых ученых НИИ ФХМ, Москва, 2013
14. Б.А. Коварский, А.С. Попенко, А.В. Тяхт, П. Мазин, Д.Г. Алексеев «Анализ генетической изменчивости кишечной микробиоты человека». Международная конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике», Новосибирск, 2013
15. А.С. Попенко, А.В. Тяхт, Д.Г. Алесеев «Особенности микробиоты кишечника российской популяции: функциональный анализ и межнациональное сравнение.», Международная конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике», Новосибирск, 2013
16. А.В. Тяхт «Метагеномное исследование временной эволюции состава микробиоты кишечника в ходе курса противораковой терапии у детей». Международная конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике», Новосибирск, 2013
17. Tyakht A.V., Popenko A.S., Zelenin A.S., Kovarsky B.A., Alexeev D.G., Karpova I.Y., Larin A.K., Solopova G.G., Dzhandarova D.T., Roumiantsev S.A., Kostryukova E.S. «Temporal evolution of gut microbiota during chemotherapy in acute leukemia pediatric patients». International Human Microbiome Congress (IHMC), Hangzhou, 2013
18. А.И. Манолов «Сборка de-novo и сравнительный анализ бактерии P. stutzeri KOS6, извлеченной из нефтяного шламма». Международная конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике», Новосибирск, 2013
19. Yuri Kosinsky, Kirill Peskov, Anna Popenko, Aleksndr Tyakht, Dmitry Alexeev «Modeling of short-chain fatty acids metabolism in human gut: reconstruction of possible relations between microbiota composition and type 2 diabetes status». FEBS, Saint-Petersburg, 2013
20. Dmitry Alexeev «Systems biology of h. pylori». FEBS, Saint-Petersburg, 2013
21. Дмитрий Алексеев, «Системная биология H.pylori» Белки и пептиды, Уфа, 2013
22. Дмитрий Алексеев, «Становление микробиоты младенца» Мать и дитя, Москва, 2013
23. Дмитрий Алексеев, «Оценка резервуара биомаркеров» Трансляционная медицина Москва, 2013
24. Дмитрий Алексеев, «Генмный анализ хирономиды» Международная конференция «Высокопроизводительное секвенирование в геномике», Новосибирск, 2013